El área de educación física busca el desarrollo integral de los estudiantes, fortaleciendo los valores francisco- amigonianos con cada una de las actividades y eventos que se realizan.

Valores como el esfuerzo, la dedicación, la responsabilidad y la autonomía son clave importante para que los estudiantes desarrollen y alcancen cada uno de los objetivos propuestos por el área para su formación.

Tradicionalmente, cada año el área de educación física organiza la inauguración de juegos intercursos, que se desarrolla dentro de la institución, este evento es de gran magnitud y cuenta con la presencia de los padres de familia con el objetivo de dar a conocer los talentos de cada estudiante y potenciarlo en las escuelas de formación y apreciación artística.